Cơ sở đào tạo chính của Trường đặt tại Tp Nha Trang, tỉnh Khánh Hòa. Ngoài ra Trường còn liên kết đào tạo tại nhiều địa phương khác trong cả nước từ Quảng Ninh đến Cà Mau
Từ năm 2005, thực hiện chỉ thị của Thủ tướng chính phủ, Trường đào tạo bậc đại học hệ chính quy các ngành Khai thác, Cơ khí, Chế biến, Nuôi trồng, Kinh tế và Kế toán tại thành phố Rạch Giá, tỉnh Kiên Giang. Ngày 06/4/2006, Phân hiệu Kiên Giang của Trường được chính thức thành lập theo Quyết định số 1704/QĐ-BGDĐT của Bộ Giáo dục và Đào tạo.
- Điều kiện sinh hoạt và học tập: Khuôn viên chính của Trường Đại học Nha Trang có tổng diện tích 23,4ha nằm trên một vùng đồi 2 mặt giáp biển, cách trung tâm thành phố Nha Trang 1,5km, cách sân bay Cam Ranh 35km, cách ga xe lửa gần 4km, cách bến xe ô tô phía Nam 5km và bến xe phía Bắc gần 2km.
- Giảng đường: Trường Đại học Nha Trang có 6 khu giảng đường - với tổng diện tích gần 12.000m2, gồm 84 phòng học có sức chứa 60¸150 SV/phòng. Tại mỗi khu giảng đường có 24 phòng học được trang bị các thiết bị chuyên dùng dành cho các môn học có sử dụng các phương tiện giảng dạy hiện đại.
- Năm 2009 Trường Đại học Nha Trang thông báo thông tin chỉ tiêu tuyển sinh Đại học và Cao đẳng năm 2009 tại trường Đại học Nha Trang như sau